Genome Biology（IF：10.5）：肠道菌群的地域密码——中国人群微生物组的独特性及其形成机制

背景：人类肠道微生物群在不同人群中表现出显著多样性，受地理、饮食和生活方式等因素影响，尤其在汉族与非汉族人群之间存在明显差异。以往研究主要关注肠道微生物组的分类学丰度，而单核苷酸多态性（SNPs）在驱动人群特异性差异方面的作用在很大程度上尚未被充分探索。 结果：本研究利用人类肠道微生物组参考基因组目录（HGMRGC），系统性地研究了汉族与非汉族人群之间的肠道微生物差异。我们发现地理因素是微生物丰度和SNPs变异的主要驱动因素。我们从柯林斯菌属（Collinsella）中鉴定出689个具有人群特异性的基因组簇，其在碳水化合物利用功能上存在差异；同时还发现108个物种在维生素生物合成、抗生素抗性和碳水化合物代谢方面表现出不同的流行特征。Beta多样性分析显示，微生物丰度和SNPs在人群间均存在显著差异；而Alpha多样性分析则揭示，非汉族人群在微生物丰度上表现出更高的多样性，汉族人群则在SNPs上显示出更大的多样性。 结论：本研究全面分析了汉族与非汉族人群之间的肠道微生物差异，凸显了人群特异性特征对微生物多样性和功能的深刻影响。我们还提供了一个全面的人类肠道微生物参考基因组目录，特别关注汉族人群，为未来肠道微生物基因组变异研究奠定了基础。