宏基因组测序（Metagenomics Sequencing）是对环境样品中的微生物群落的基因组进行高通量测序，主要研究微生物种群结构、基因功能活性、微生物之间的相互协作关系以及微生物与环境之间的关系。

优势

技术路线

分析内容

送样建议

1.粪便、土壤、水体等样本；

2.建议DNA起始量≥1 μg；最低起始量≥ 200 ng；

3.样本采集后，请尽快将样本置于-80 ℃保存或液氮速冻保存，或马上进行样本 DNA 抽提，避免样本储存不当影响实验结果；

4.不接收含病原微生物的人源样本，或是含有可传人病原微生物的哺乳动物来源的样本，或是无法判断是否有危害的样本，但可以接收病原微生物或上述样本提取的 DNA 样本，或是已做灭活处理的致病菌样本；

5. 整个样本采集过程，都须遵守无菌操作；

6.粪便（人/牛/羊/鸡/鸭/鼠）：扩增子测序（16S/ITS等）50-100mg，宏基因组测序100-300mg；

7.肠道内容物（人/牛/羊/鸡/鸭）：扩增子测序（16S/ITS等）50-300mg，宏基因组测序100-300mg；肠道内容物（小鼠等小型动物）：扩增子测序（16S/ITS等）50-100mg，宏基因组测序100-200mg；

8.唾液样本：扩增子测序（16S/ITS等）2-5mL，宏基因组测序不推荐；

9.阴道或子宫等生殖器官样本：扩增子测序（16S/ITS等）擦拭纸/棉拭子2-3根，宏基因组测序不推荐；

10.口腔样本：扩增子测序（16S/ITS等）擦拭纸/棉拭子2-3根，宏基因组测序不推荐；

11.皮肤样本：扩增子测序（16S/ITS等）擦拭纸/棉拭子5-6根，宏基因组测序不推荐；

12.DNA样本扩增子测序：样本起始量>50ng，浓度>10ng/μL，体积>20μL，纯度1.8≤OD260/280≤2.0、1.5≤OD260/230≤2.0，样本无色透明不粘稠，电泳主带完整，无弥散或拖尾；

13.宏基因组测序：样本起始量>1μg，浓度>50ng/μL，体积>20μL，纯度1.8≤OD260/280≤2.0、1.5≤OD260/230≤2.0，样本无色透明不粘稠，电泳主带完整，无弥散或拖尾；

Metagenomic sequencing